Das Institut für Inflammation und Neurodegeneration (IIN) wird seit Oktober 2016 von Frau Prof. Dr. Ildiko Rita Dunay geleitet. Im Fokus der Forschungsarbeit steht die Analyse der Kommunikation von Immunzellen des angeborenen Immunsystems, wie zum Beispiel Mikrogliazellen, Monozyten und Innate Lymphoid Cells mit den Zellen des zentralen Nervensystems während einer Infektion. Darüber hinaus erforscht das IIN die Modulation der Homöostase des Gehirns durch den Einfluss von Darmflora und peripheren Infektionen sowie die Auswirkungen von Toxoplasmose auf den Verlauf neurodegenerativer Erkrankungen.